По одной из версий, сыр сулугуни происходит из городка Самегрело в Сванетии, и по-мегрельски его название звучит как селегин. Селе (мешать, замешивать) и гин (крупнорогатый скот). В то же время в Осетии этот сыр называют сулу-гун (созданный из сыворотки), что ближе к русскому названию. До сих пор в ходу две версии происхождения сыра, но народная грузинская расшифровка примиряет обе версии, трактуя сулу как сули (душа) и гуни – как гули (сердце).